Madrasah Tsanawiyah MTs. Mujahidin merupakan lembaga pendidikan setingkat SMP Sekolah Menengah Pertama dibawah naungan Pesantren Wisata Al-Qur’an PWQ Yayasan Badan Wakaf Mujahidin YBWM  dengan cita cita mulia yaitu mewujudkan sumber daya manusia yang bermoral Qur’ani, berkepribadian Indonesia, berjiwa mandiri (enterpreuneur), menguasai ilmu pengetahuan dan teknologi serta mampu mengaktualisasikannya dalam masyarakat.

MTs Mujahidin terakreditasi A menjadi lembaga pendidikan yang dikenal luas, baik secara prestasi maupun secara metode pembelajaran yang mengkombinasikan kurikulum nasional dengan kurikulum KMI Gontor terpadu dalam sistem pembelajaran Hybrid Learning System menggunakan gadget Google Chromebook mitra GFE Goggle For Education sejak tahun 2020.

Sederet prestasi santri dari tahun ke tahun mulai tingkat kabupaten, propinsi, sampai tingkat Nasional yaitu Juara 3 Santri Digital Preneur Indonesia pada Oktober 2023 di Jakarta, dan segudang prestasi lainnya bidang kesenian, tahfidz, sains, teknologi dan keterampilan